Nació en Azcárate. Contrajo matrimonio con María de Izu, originaria de la casa llamada "Margurena", la cual fallece en Asiaín (Navarra) en febrero de 1590 (asentada la partida de su defunción en el libro primero de la parroquía de la Asunción de Nuestra Señora el día 8, citando su texto que era mujer de Don Joanes de Azcárate).

Tuvo dos hijos, Don Juan de Azcárate e Izu "el mayor" y Don Juan de Azcárate e Izu "el menor".

Información obtenida del libro --> Historia genealógica de los Títulos rehabilitados durante el reinado de Don Alfonso XIII. Doña Margarita Zabala Menéndez. Tomo VI. Logroño, 2009.